In den späten 1980er-Jahren begann Honda mit der Entwicklung eines kleinen Geschäftsflugzeugs, das mit Strahltriebwerken anderer Hersteller angetrieben werden sollte. Der Prototyp, die Honda MH02, wurde um 1990 in Zusammenarbeit mit der Mississippi State University als Experimentalflugzeug gebaut. Diese Entwicklung mündete in der Konstruktion eines eigenen kleinen Mantelstromtriebwerks, dem GE Honda HF120 von 1999. Das Triebwerk, eine Gemeinschaftsentwicklung mit GE Aviation, wurde zu Testzwecken in eine Cessna Citation und eine umgebaute Boeing 727-100, später auch in eine Lockheed T-33 Shooting Star eingebaut. Der Jet wird in Greensboro (North Carolina), am Piedmont Triad International Airport produziert.In seiner Klasse der leichten Geschäftsreiseflugzeuge ist die Honda HA-420 im Vergleich zu seinen direkten Konkurrenten von Embraer (Embraer EMB-500) und Cessna ein Neueinsteiger, hatte aber von 2017 bis 2020 die größten Marktanteile seiner Klasse.

Am 17. Oktober 2022 stellte Honda Aircraft auf der National Aviation Convention and Exhibition (NBAA-Bace) in Orlando (Florida) den "HondaJet Elite II" vor. Der neue Jet verspricht eine erhöhte Reichweite von 1.547 sm (2.865 km) verbunden mit zusätzlichen Automations- und Sicherheitsdetails durch Autothrottle und Garmins automatischem Landesystem Emergency Autoland. Durch das Update verfügt der Jet über eine neu designte Kabine mit erweiterten Interieur-Optionen. Der Verkaufspreis wird mit 6,95 Mio. US-Dollar angegeben.